QIAGEN CLC Genomics Workbench和QCI Interpret 適用於 Element AVITI定序儀
QIAGEN CLC Genomics Workbench和QCI Interpret 適用於 Element AVITI定序儀
適用於低至中通量的 NGS 實驗室
建立您的工作流程，包含四個 NGS 步驟
STEP 1：文庫製備 (Library preparation)
QIAseq Panel為NGS基因分型樹立了新標準。該化學試劑的重大創新提高了易用性、效率和擴展的變異分析，以簡化和加快您的 NGS 工作流程。
- 完整、均勻的靶標覆蓋 – 單管富集多達 20,000 個 DNA 靶標（多模式可額外富集 8,000 個 RNA）引物在靶標區域交錯放置，可確保高均一性 （>99%） 和完全覆蓋。
- 高兼容性與挑戰性樣本 – 適用於 FFPE 樣本、血漿/血清、新鮮或冷凍樣本組織、細胞株、液體活檢，最低 DNA 輸入要求低至 10 ng。
- 與具有挑戰性的樣品高度相容 — 適用於 FFPE 樣品、血漿/血清、新鮮或冷凍組織、細胞系、液體活檢，最低 DNA 起始量要求低至 10 ng。
- 單日自動化文庫製備 – 在8小時或更短的時間內從樣品到定序就緒文庫，手動操作時間最短。
- 定製變得簡單 – 如果缺少任何內容，可以使用額外的內容來增強任何編目檢測組合，或者使用靈活的 GeneGlobe 定製生成器或專家設計檢測組合來設計定製檢測組合。
- 使用多模式方法進行泛癌種分析 – 全面的基因組分析工作流程，用於同時檢測實體瘤和血紅素惡性腫瘤中的 DNA 變異、RNA fusion和TMB/MSI 狀態。
STEP 2: 定序 (Sequencing)
Element AVITI System Sequencing Instrument
Element Biosciences 的 AVITI™ 系統是一款開箱即用的桌上型定序儀，提供無與倫比的性能、成本和靈活性組合。與其他台式系統相比，Element 專有的 Avidity 測序™化學試劑可實現卓越的準確性和成本效益。AVITI™ 系統具有兩個隨機存取流通池，相當於將兩個定序系統合二為一。
- 行業領先的準確性 – 在 2×150 讀長下，AVITI™ 系統具有超過 90% 的 Q30，可為全面的 NGS 應用提供卓越的測序準確度。
- 簡單易用 – AVITI™ 透過引導工作流程、全面的運行參數和靈活的系統設置，為各種規模和具備不同 NGS 經驗的實驗室提供支援。
STEP 3: 彈性且高速的分析技術
CLC Genomics Workbench with LightSpeed
LightSpeed 是 QIAGEN CLC Genomics Workbench 的一個新模組，使實驗室能夠以前所未有的運行時間進行高精度的 NGS 二次分析。從 AVITI™ 系統生成的 FASTQ 文件串接到 LightSpeed。在幾分鐘內（或更短時間內），LightSpeed 生成包含單核苷酸變異（SNV）、插入-缺失突變（InDel）和結構變異（SV）調用的 VCF 文件。該模組可使用本地運算主機使用，或 Amazon Web Services (AWS®) 雲部署。
- 可跨平台的 – 分析工作流程是根據供應商的panel量身定制的。
- 超快速 – 處理一個 35x 覆蓋率的全基因組測序樣本需要不到 20 分鐘。
- 成本效益高 – 利用CPU運算，無需另外特規硬體 (GPU or FPGA)。
STEP 4: 數據解讀和報告產出
QCI Interpret
QCI Interpret 是一款點開即用、完全可定制的軟體解決方案，能夠實現腫瘤學和遺傳應用的 NGS 變異解讀和報告產出。來自 CLC Genomics Workbench 的 VCF 文件會直接上傳到 QCI Interpret。用戶然後選擇預配置的工作流程，QCI Interpret 會根據 ACMG 和 AMP/ASCO/CAP 專業指南自動篩選變異並計算分類。與其他第三級分析解決方案不同，QCI Interpret 使用增強的分子智能（人類和機器策展的結合）來確保所考慮的證據是準確、一致和最新的。用戶然後可以審查支持每個變異分類的文獻和標準，確定可報告性狀態，並自信地生成包含可信診斷、預後和治療資訊的為病患客製分析的精準報告。
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